Ing. Jan Kudláček, DiS., Ph.D.
Vedoucí týmu
Skupina experimentální neurofyziologie
Ústav fyziologie 2. LF UK
Profesní zkušenosti
Během studia na Fakultě elektrotechnické ČVUT jsem se zabýval především zvukovou technikou zpracováním signálů. Po dokončení inženýrského oboru jsem se rozhodl pro Ph.D. studium. Z několika možností mě nejvíce zaujal prof. Přemysl Jiruška, a tak jsem se dostal k experimentálnímu výzkumu epilepsie. Naučil jsem se práci s laboratorními hlodavci a osvojil si in vivo elektrofyziologii. Také jsem se zdokonalil v analýze signálů v prostředí Matlab. V dizertační práci jsem se zabýval dlouhodobou dynamikou epileptických záchvatů. Po dokončení Ph.D. jsem jel na rok na University of Lund, kde jsem se naučil patch-clamp (záznam z jednoho neuronu), optogenetiku a chemogenetiku. Nyní působím na Ústavu fyziologie 2. lékařské fakulty Univerzity Karlovy jako vedoucí Skupiny experimentální neurofyziologie.
Výzkumné zájmy
Nyní se zabývám především studiem pomalých fluktuací v riziku záchvatu. Tyto fluktuace mají periodu v řádu dnů, týdnů nebo měsíců a vyskytují se u většiny pacientů s epilepsií a také v animálních modelech epilepsie. Bylo popsáno, že fluktuace v riziku záchvatu jsou provázány s cyklickými změnami mezizáchvatového EEG signálu. Animální modely epilepsie přináší možnost detailnějšího sledování pomalých cyklů než je možné u pacientů. Proto studujeme výskyt a charakteristiku záchvatů, mezizáchvatový EEG signál a také některé rysy chování pomocí automatizovaného zpracování videa. Cílem je nalézt způsob, jak předpovídat riziko záchvatu.
Kromě toho se zabývám studiem buněčných mechanizmů vzniku záchvatů ve fokální kortikální dysplázii (FCD). Pomocí optogenetiky a chemogenetiky se snažíme spouštět nebo potlačovat aktivitu různých typů nervových buněk a z elektrofyziologických záznamů analyzovat vliv těchto manipulací na epileptickou aktivitu. Věřím, že naše zjištění přispějí k vývoji genové léčby epilepsie.
Ačkoli se rád podílím na experimentální práci v laboratoři, většinu pracovního času trávím u počítače tvorbou měřicích protokolů a analýzami naměřených dat.
Vybrané publikace
Prochazkova, N.; Nguyenova, M.; Rehorova, M.; Kudlacek, J.; Chvojka, J.; Ziak, J.; Balastik, M.; Otahal, J.; Jiruska, P.; Novak, O. (2024). NeuroPorator: An open-source, current-limited electroporator for safe in utero gene transfer. Journal of Neuroscience Methods. 406:110126. https://doi.org/10.1016/j.jneumeth.2024.110126
Chvojka, J.; Prochazkova, N.; Rehorova, M.; Kudlacek, J.; Kylarova, S.; Kralikova, M.; Buran, P.; Weissova, R.; Balastik, M.; Jefferys, J.G.R.; Novak, O.; Jiruska, P. (2024). Mouse model of focal cortical dysplasia type II generates a wide spectrum of high-frequency activities. Neurobiology of Disease. 190:106383. https://doi.org/10.1016/j.nbd.2023.106383
Waloschkova, E.; Gonzalez-Ramos, A.; Mikroulis, A.; Kudláček, J.; Andersson, M.; Ledri, M.; Kokaia, M. (2022). Human Stem Cell-Derived GABAergic Interneurons Establish Efferent Synapses onto Host Neurons in Rat Epileptic Hippocampus and Inhibit Spontaneous Recurrent Seizures. International Journal of Molecular Sciences. 22(24):13243. https://doi.org/10.3390/ijms222413243
Kudlacek, J.; Chvojka, J.; Kumpost, V.; Heřmanovská, B.; Posusta, A.; Jefferys, J.; Maturana, M.; Novak, O.; Cook, M.; Otáhal, J.; Hlinka, J.; Jiruska, P. (2021). Long-term seizure dynamics are determined by the nature of seizures and the mutual interactions between them. Neurobiology of Disease. 154. 105347. https://doi.org/10.1016/j.nbd.2021.105347
Maturana, M.; Meisel, C.; Dell, K.; Karoly, P.; D’Souza, W.; Grayden, D.; Burkitt, A.; Jiruska, P.; Kudlacek, J.; Hlinka, J.; Cook, M.; Kuhlmann, L.; Freestone, D. (2020). Critical slowing down as a biomarker for seizure susceptibility. Nature Communications. 11. 2172. https://doi.org/10.1038/s41467-020-15908-3
Chvojka, J.; Kudlacek, J.; Chang, W.C.; Novak, O.; Tomaska, F.; Otáhal, J.; Jefferys, J.; Jiruska, P. (2019). The role of interictal discharges in ictogenesis — A dynamical perspective. Epilepsy & Behavior. 106591. https://doi.org/10.1016/j.yebeh.2019.106591
Chang, W.C.; Kudlacek, J.; Hlinka, J.; Chvojka, J.; Hadrava, M.; Kumpost, V.; Powell, A.; Janca, R.; Maturana, M.; Karoly, P.; Freestone, D.; Cook, M.; Palus, M.; Otahal, J.; Jefferys, J.; Jiruska, P. (2018). Loss of neuronal network resilience precedes seizures and determines the ictogenic nature of interictal synaptic perturbations. Nature Neuroscience. https://doi.org/10.1038/s41593-018-0278-y
Kudlacek, J.; Chvojka, J.; Posusta, A.; Kovacova, L.; Hong, S.; Weiss, S.; Volna, K.; Marusic, P.; Otáhal, J.; Jiruska, P. (2017). Lacosamide and Levetiracetam Have No Effect on Sharp-Wave Ripple Rate. Frontiers in Neurology. 8. https://doi.org/10.3389/fneur.2017.00687